Tại thời điểm thành lập, Quỹ phát triển khoa học và công nghệ phải có vốn tối thiểu là 5 tỷ đồng.
Thủ tướng Chính phủ đã ký Quyết định số 37/2015/QĐ-TTg quy định điều kiện thành lập Quỹ phát triển khoa học và công nghệ của Bộ, cơ quan ngang Bộ, cơ quan thuộc Chính phủ, tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương.
Theo quyết định này, tại thời điểm thành lập, Quỹ phát triển khoa học và công nghệ phải có vốn tối thiểu là 5 tỷ đồng, trong đó phần kinh phí hỗ trợ, đóng góp từ nguồn vốn ngoài ngân sách nhà nước tối thiểu đạt 10%. Nguồn vốn của Quỹ phát triển khoa học và công nghệ do ngân sách nhà nước cấp lần đầu, vốn bổ sung để thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ hằng năm được phân bổ từ dự toán chi sự nghiệp khoa học và công nghệ, các nguồn thu từ kết quả hoạt động của quỹ, kinh phí đóng góp từ quỹ phát triển khoa học và công nghệ của doanh nghiệp nhà nước trực thuộc…
Nhân sự của quỹ được bố trí theo điều kiện thực tế và không làm tăng tổng số biên chế hiện có của Bộ, UBND cấp tỉnh; các nhân sự có thể chuyên trách hoặc kiêm nhiệm, riêng kế toán trưởng của quỹ phải là nhân sự chuyên trách. Về trình độ chuyên môn, nhân sự được dự kiến bố trí làm Giám đốc điều hành quỹ phải có trình độ đại học trở lên và có tối thiểu 5 năm kinh nghiệm công tác quản lý khoa học và công nghệ; nhân sự dự kiến bố trí kế toán trưởng ngoài việc phải đáp ứng các tiêu chuẩn bổ nhiệm kế toán trưởng theo quy định hiện hành còn phải có tối thiểu 5 năm kinh nghiệm công tác về kế toán.
Quyết định này có hiệu lực thi hành từ ngày 25-10-2015.